Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYD8

FANCM, Fanconi anemia group M protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCMQ8IYD8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FANCMQ8IYD8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FANCMQ8IYD8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FANCMQ8IYD8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FANCMQ8IYD8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FANCMQ8IYD8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FANCMQ8IYD8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FANCMQ8IYD8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FANCMQ8IYD8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCMQ8IYD8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FANCMQ8IYD8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FANCMQ8IYD8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FANCMQ8IYD8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FANCMQ8IYD8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FANCMQ8IYD8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCMQ8IYD8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCMQ8IYD8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCMQ8IYD8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCMQ8IYD8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCMQ8IYD8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCMQ8IYD8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCMQ8IYD8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCMQ8IYD8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCMQ8IYD8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCMQ8IYD8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms