Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SHROOM2Q13796 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SHROOM2Q13796 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SHROOM2Q13796 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SHROOM2Q13796 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SHROOM2Q13796 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SHROOM2Q13796 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
SHROOM2Q13796 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
SHROOM2Q13796 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SHROOM2Q13796 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SHROOM2Q13796 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SHROOM2Q13796 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
SHROOM2Q13796 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
SHROOM2Q13796 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SHROOM2Q13796 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
SHROOM2Q13796 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
SHROOM2Q13796 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
SHROOM2Q13796 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SHROOM2Q13796 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SHROOM2Q13796 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SHROOM2Q13796 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SHROOM2Q13796 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SHROOM2Q13796 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SHROOM2Q13796 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SHROOM2Q13796 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SHROOM2Q13796 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SHROOM2Q13796 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SHROOM2Q13796 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SHROOM2Q13796 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
SHROOM2Q13796 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SHROOM2Q13796 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SHROOM2Q13796 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SHROOM2Q13796 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SHROOM2Q13796 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SHROOM2Q13796 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SHROOM2Q13796 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SHROOM2Q13796 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
SHROOM2Q13796 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SHROOM2Q13796 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
SHROOM2Q13796 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SHROOM2Q13796 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SHROOM2Q13796 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SHROOM2Q13796 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SHROOM2Q13796 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
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