Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCOCO2Q13137 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms