Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNEQ04844 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHRNEQ04844 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms