Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00205P59089 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00205P59089 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms