Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP6P35125 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP6P35125 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP6P35125 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP6P35125 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP6P35125 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP6P35125 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP6P35125 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP6P35125 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP6P35125 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
USP6P35125 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
USP6P35125 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
USP6P35125 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
USP6P35125 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
USP6P35125 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP6P35125 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP6P35125 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP6P35125 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP6P35125 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP6P35125 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP6P35125 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP6P35125 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
USP6P35125 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP6P35125 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP6P35125 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP6P35125 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP6P35125 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP6P35125 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP6P35125 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP6P35125 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP6P35125 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP6P35125 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP6P35125 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP6P35125 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP6P35125 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP6P35125 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP6P35125 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP6P35125 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP6P35125 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP6P35125 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP6P35125 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
USP6P35125 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP6P35125 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP6P35125 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP6P35125 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
USP6P35125 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.38
USP6P35125 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP6P35125 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP6P35125 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP6P35125 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP6P35125 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP6P35125 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP6P35125 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP6P35125 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP6P35125 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP6P35125 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP6P35125 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP6P35125 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
USP6P35125 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP6P35125 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
USP6P35125 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP6P35125 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP6P35125 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP6P35125 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP6P35125 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
USP6P35125 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP6P35125 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP6P35125 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP6P35125 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP6P35125 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP6P35125 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
USP6P35125 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP6P35125 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP6P35125 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP6P35125 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP6P35125 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP6P35125 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP6P35125 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP6P35125 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP6P35125 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP6P35125 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP6P35125 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP6P35125 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP6P35125 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP6P35125 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP6P35125 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP6P35125 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP6P35125 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP6P35125 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
USP6P35125 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
USP6P35125 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP6P35125 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP6P35125 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP6P35125 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
USP6P35125 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP6P35125 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP6P35125 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP6P35125 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP6P35125 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP6P35125 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms