Protein–RNA interactions for Protein: P17096

HMGA1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA1P17096 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMGA1P17096 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGA1P17096 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms