Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8D1

PDCD7, Programmed cell death protein 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD7Q8N8D1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDCD7Q8N8D1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD7Q8N8D1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms