Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB35Q15286 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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RAB35Q15286 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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RAB35Q15286 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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RAB35Q15286 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB35Q15286 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
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