Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
COL19A1Q14993 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
COL19A1Q14993 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms