Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms