Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPA3P35244 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPA3P35244 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPA3P35244 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPA3P35244 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPA3P35244 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPA3P35244 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RPA3P35244 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RPA3P35244 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPA3P35244 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPA3P35244 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPA3P35244 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPA3P35244 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPA3P35244 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPA3P35244 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPA3P35244 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPA3P35244 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPA3P35244 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPA3P35244 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPA3P35244 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPA3P35244 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPA3P35244 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPA3P35244 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPA3P35244 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPA3P35244 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPA3P35244 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPA3P35244 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPA3P35244 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPA3P35244 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPA3P35244 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPA3P35244 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPA3P35244 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPA3P35244 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPA3P35244 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RPA3P35244 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPA3P35244 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPA3P35244 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPA3P35244 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPA3P35244 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPA3P35244 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPA3P35244 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPA3P35244 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPA3P35244 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPA3P35244 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPA3P35244 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPA3P35244 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPA3P35244 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPA3P35244 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPA3P35244 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RPA3P35244 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPA3P35244 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPA3P35244 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPA3P35244 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPA3P35244 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPA3P35244 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPA3P35244 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPA3P35244 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPA3P35244 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPA3P35244 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPA3P35244 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RPA3P35244 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPA3P35244 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPA3P35244 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPA3P35244 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPA3P35244 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPA3P35244 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPA3P35244 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPA3P35244 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPA3P35244 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPA3P35244 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPA3P35244 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPA3P35244 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPA3P35244 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPA3P35244 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPA3P35244 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPA3P35244 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPA3P35244 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPA3P35244 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPA3P35244 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPA3P35244 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPA3P35244 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPA3P35244 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPA3P35244 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPA3P35244 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPA3P35244 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPA3P35244 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPA3P35244 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPA3P35244 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPA3P35244 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPA3P35244 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPA3P35244 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPA3P35244 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPA3P35244 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPA3P35244 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPA3P35244 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPA3P35244 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPA3P35244 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPA3P35244 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPA3P35244 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPA3P35244 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms