Protein–RNA interactions for Protein: O15146

MUSK, Muscle, skeletal receptor tyrosine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUSKO15146 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MUSKO15146 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MUSKO15146 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MUSKO15146 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MUSKO15146 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MUSKO15146 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MUSKO15146 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MUSKO15146 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MUSKO15146 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MUSKO15146 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MUSKO15146 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MUSKO15146 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MUSKO15146 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MUSKO15146 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MUSKO15146 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MUSKO15146 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MUSKO15146 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MUSKO15146 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MUSKO15146 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MUSKO15146 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MUSKO15146 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MUSKO15146 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MUSKO15146 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MUSKO15146 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MUSKO15146 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MUSKO15146 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MUSKO15146 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MUSKO15146 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MUSKO15146 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MUSKO15146 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MUSKO15146 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MUSKO15146 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MUSKO15146 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MUSKO15146 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MUSKO15146 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MUSKO15146 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MUSKO15146 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MUSKO15146 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MUSKO15146 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MUSKO15146 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MUSKO15146 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MUSKO15146 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MUSKO15146 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MUSKO15146 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MUSKO15146 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MUSKO15146 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MUSKO15146 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MUSKO15146 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MUSKO15146 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MUSKO15146 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MUSKO15146 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MUSKO15146 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MUSKO15146 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MUSKO15146 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MUSKO15146 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MUSKO15146 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MUSKO15146 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MUSKO15146 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MUSKO15146 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MUSKO15146 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MUSKO15146 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MUSKO15146 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MUSKO15146 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MUSKO15146 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MUSKO15146 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MUSKO15146 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MUSKO15146 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MUSKO15146 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MUSKO15146 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MUSKO15146 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MUSKO15146 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MUSKO15146 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MUSKO15146 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MUSKO15146 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MUSKO15146 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MUSKO15146 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MUSKO15146 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MUSKO15146 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MUSKO15146 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MUSKO15146 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MUSKO15146 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MUSKO15146 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MUSKO15146 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MUSKO15146 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MUSKO15146 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MUSKO15146 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MUSKO15146 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MUSKO15146 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MUSKO15146 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MUSKO15146 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MUSKO15146 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MUSKO15146 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MUSKO15146 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MUSKO15146 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MUSKO15146 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MUSKO15146 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MUSKO15146 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MUSKO15146 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MUSKO15146 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MUSKO15146 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.7 ms