Protein–RNA interactions for Protein: A6NEV1

PRR23A, Proline-rich protein 23A, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR23AA6NEV1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRR23AA6NEV1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRR23AA6NEV1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRR23AA6NEV1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRR23AA6NEV1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRR23AA6NEV1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRR23AA6NEV1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRR23AA6NEV1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRR23AA6NEV1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRR23AA6NEV1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRR23AA6NEV1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRR23AA6NEV1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRR23AA6NEV1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRR23AA6NEV1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRR23AA6NEV1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRR23AA6NEV1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRR23AA6NEV1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRR23AA6NEV1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRR23AA6NEV1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRR23AA6NEV1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRR23AA6NEV1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRR23AA6NEV1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRR23AA6NEV1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRR23AA6NEV1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRR23AA6NEV1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRR23AA6NEV1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRR23AA6NEV1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRR23AA6NEV1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRR23AA6NEV1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRR23AA6NEV1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRR23AA6NEV1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRR23AA6NEV1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRR23AA6NEV1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRR23AA6NEV1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRR23AA6NEV1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRR23AA6NEV1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRR23AA6NEV1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRR23AA6NEV1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR23AA6NEV1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms