Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E3

PCDHB6, Protocadherin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB6Q9Y5E3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHB6Q9Y5E3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHB6Q9Y5E3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms