Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NOP58Q9Y2X3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NOP58Q9Y2X3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms