Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LRRC4BQ9NT99 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC4BQ9NT99 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms