Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC34Q96HJ3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms