Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX2

ATXN7L3B, Ataxin-7-like protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L3BQ96GX2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATXN7L3BQ96GX2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATXN7L3BQ96GX2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms