Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC37.71■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
TOPBP1Q92547 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.62
TOPBP1Q92547 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
TOPBP1Q92547 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
TOPBP1Q92547 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
TOPBP1Q92547 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
TOPBP1Q92547 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
TOPBP1Q92547 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
TOPBP1Q92547 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
TOPBP1Q92547 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
TOPBP1Q92547 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
TOPBP1Q92547 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC37.68■■■■□ 3.62
TOPBP1Q92547 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
TOPBP1Q92547 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
TOPBP1Q92547 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
TOPBP1Q92547 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
TOPBP1Q92547 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
TOPBP1Q92547 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
TOPBP1Q92547 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
TOPBP1Q92547 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
TOPBP1Q92547 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
TOPBP1Q92547 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
TOPBP1Q92547 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
TOPBP1Q92547 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
TOPBP1Q92547 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TOPBP1Q92547 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TOPBP1Q92547 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TOPBP1Q92547 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
TOPBP1Q92547 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.62
TOPBP1Q92547 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC37.63■■■■□ 3.62
TOPBP1Q92547 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC37.59■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.61
TOPBP1Q92547 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms