Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATRIPQ8WXE1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATRIPQ8WXE1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms