Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTL3Q8N8U3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTL3Q8N8U3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTL3Q8N8U3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTL3Q8N8U3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTL3Q8N8U3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTL3Q8N8U3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTL3Q8N8U3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTL3Q8N8U3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTL3Q8N8U3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTL3Q8N8U3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTL3Q8N8U3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTL3Q8N8U3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTL3Q8N8U3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTL3Q8N8U3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTL3Q8N8U3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTL3Q8N8U3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTL3Q8N8U3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTL3Q8N8U3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTL3Q8N8U3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTL3Q8N8U3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTL3Q8N8U3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTL3Q8N8U3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTL3Q8N8U3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTL3Q8N8U3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTL3Q8N8U3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTL3Q8N8U3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTL3Q8N8U3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTL3Q8N8U3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTL3Q8N8U3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTL3Q8N8U3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTL3Q8N8U3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTL3Q8N8U3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTL3Q8N8U3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTL3Q8N8U3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTL3Q8N8U3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTL3Q8N8U3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTL3Q8N8U3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTL3Q8N8U3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTL3Q8N8U3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTL3Q8N8U3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTL3Q8N8U3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms