Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC93Q567U6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CCDC93Q567U6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC93Q567U6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms