Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAM3AP98173 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM3AP98173 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM3AP98173 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms