Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTNP21246 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTNP21246 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTNP21246 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTNP21246 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTNP21246 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTNP21246 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTNP21246 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTNP21246 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTNP21246 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTNP21246 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTNP21246 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTNP21246 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTNP21246 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTNP21246 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTNP21246 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTNP21246 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTNP21246 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTNP21246 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTNP21246 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTNP21246 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTNP21246 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTNP21246 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTNP21246 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTNP21246 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTNP21246 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTNP21246 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTNP21246 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTNP21246 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTNP21246 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTNP21246 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTNP21246 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTNP21246 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTNP21246 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTNP21246 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTNP21246 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTNP21246 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTNP21246 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTNP21246 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTNP21246 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTNP21246 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTNP21246 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTNP21246 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTNP21246 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTNP21246 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTNP21246 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTNP21246 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTNP21246 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTNP21246 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTNP21246 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTNP21246 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTNP21246 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTNP21246 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTNP21246 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTNP21246 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTNP21246 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTNP21246 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTNP21246 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTNP21246 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTNP21246 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTNP21246 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTNP21246 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTNP21246 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTNP21246 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTNP21246 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTNP21246 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTNP21246 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTNP21246 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTNP21246 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTNP21246 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTNP21246 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTNP21246 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTNP21246 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTNP21246 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTNP21246 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTNP21246 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTNP21246 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTNP21246 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTNP21246 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTNP21246 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTNP21246 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTNP21246 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTNP21246 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTNP21246 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTNP21246 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTNP21246 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTNP21246 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTNP21246 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTNP21246 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTNP21246 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTNP21246 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTNP21246 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTNP21246 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTNP21246 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTNP21246 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTNP21246 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTNP21246 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTNP21246 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTNP21246 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTNP21246 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms