Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP19O94966 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP19O94966 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP19O94966 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP19O94966 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP19O94966 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP19O94966 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
USP19O94966 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP19O94966 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP19O94966 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP19O94966 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP19O94966 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP19O94966 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP19O94966 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP19O94966 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP19O94966 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP19O94966 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP19O94966 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP19O94966 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP19O94966 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
USP19O94966 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
USP19O94966 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
USP19O94966 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
USP19O94966 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
USP19O94966 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
USP19O94966 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
USP19O94966 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP19O94966 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP19O94966 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP19O94966 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP19O94966 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP19O94966 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP19O94966 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP19O94966 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP19O94966 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP19O94966 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP19O94966 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP19O94966 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP19O94966 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP19O94966 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP19O94966 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP19O94966 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP19O94966 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP19O94966 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP19O94966 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP19O94966 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
USP19O94966 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
USP19O94966 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP19O94966 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP19O94966 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP19O94966 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP19O94966 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP19O94966 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP19O94966 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP19O94966 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP19O94966 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP19O94966 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP19O94966 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
USP19O94966 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP19O94966 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP19O94966 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP19O94966 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP19O94966 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP19O94966 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP19O94966 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP19O94966 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP19O94966 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP19O94966 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP19O94966 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP19O94966 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP19O94966 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP19O94966 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP19O94966 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP19O94966 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP19O94966 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
USP19O94966 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP19O94966 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP19O94966 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP19O94966 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP19O94966 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP19O94966 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP19O94966 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP19O94966 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP19O94966 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP19O94966 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP19O94966 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP19O94966 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP19O94966 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP19O94966 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP19O94966 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP19O94966 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
USP19O94966 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
USP19O94966 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
USP19O94966 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
USP19O94966 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
USP19O94966 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP19O94966 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP19O94966 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP19O94966 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP19O94966 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms