Protein–RNA interactions for Protein: O60658

PDE8A, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8A, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8AO60658 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PDE8AO60658 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PDE8AO60658 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE8AO60658 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PDE8AO60658 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PDE8AO60658 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PDE8AO60658 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
PDE8AO60658 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PDE8AO60658 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE8AO60658 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PDE8AO60658 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE8AO60658 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE8AO60658 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PDE8AO60658 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PDE8AO60658 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PDE8AO60658 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE8AO60658 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PDE8AO60658 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE8AO60658 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE8AO60658 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PDE8AO60658 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PDE8AO60658 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PDE8AO60658 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PDE8AO60658 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE8AO60658 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE8AO60658 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PDE8AO60658 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PDE8AO60658 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE8AO60658 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE8AO60658 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE8AO60658 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE8AO60658 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE8AO60658 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE8AO60658 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDE8AO60658 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE8AO60658 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE8AO60658 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE8AO60658 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE8AO60658 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE8AO60658 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE8AO60658 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE8AO60658 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE8AO60658 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE8AO60658 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE8AO60658 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE8AO60658 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE8AO60658 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE8AO60658 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE8AO60658 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE8AO60658 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE8AO60658 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE8AO60658 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE8AO60658 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE8AO60658 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms