Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZDHHC3Q9NYG2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC3Q9NYG2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms