Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATAD3AQ9NVI7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATAD3AQ9NVI7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms