Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUDCD1Q96RS6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NUDCD1Q96RS6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUDCD1Q96RS6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms