Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
LMOD2Q6P5Q4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LMOD2Q6P5Q4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
LMOD2Q6P5Q4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
LMOD2Q6P5Q4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
LMOD2Q6P5Q4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
LMOD2Q6P5Q4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
LMOD2Q6P5Q4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
LMOD2Q6P5Q4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
LMOD2Q6P5Q4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
LMOD2Q6P5Q4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
LMOD2Q6P5Q4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
LMOD2Q6P5Q4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
LMOD2Q6P5Q4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
LMOD2Q6P5Q4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LMOD2Q6P5Q4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LMOD2Q6P5Q4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LMOD2Q6P5Q4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LMOD2Q6P5Q4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LMOD2Q6P5Q4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LMOD2Q6P5Q4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LMOD2Q6P5Q4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LMOD2Q6P5Q4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LMOD2Q6P5Q4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LMOD2Q6P5Q4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LMOD2Q6P5Q4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LMOD2Q6P5Q4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LMOD2Q6P5Q4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LMOD2Q6P5Q4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
LMOD2Q6P5Q4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LMOD2Q6P5Q4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms