Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGU0

TSPO2, Translocator protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPO2Q5TGU0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TSPO2Q5TGU0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TSPO2Q5TGU0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TSPO2Q5TGU0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TSPO2Q5TGU0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TSPO2Q5TGU0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TSPO2Q5TGU0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TSPO2Q5TGU0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TSPO2Q5TGU0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TSPO2Q5TGU0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TSPO2Q5TGU0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TSPO2Q5TGU0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSPO2Q5TGU0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSPO2Q5TGU0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSPO2Q5TGU0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSPO2Q5TGU0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSPO2Q5TGU0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSPO2Q5TGU0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSPO2Q5TGU0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSPO2Q5TGU0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSPO2Q5TGU0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TSPO2Q5TGU0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSPO2Q5TGU0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSPO2Q5TGU0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPO2Q5TGU0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPO2Q5TGU0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPO2Q5TGU0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPO2Q5TGU0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPO2Q5TGU0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPO2Q5TGU0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPO2Q5TGU0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPO2Q5TGU0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPO2Q5TGU0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPO2Q5TGU0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms