Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NTRK2Q16620 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NTRK2Q16620 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms