Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FXNQ16595 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FXNQ16595 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
FXNQ16595 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FXNQ16595 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FXNQ16595 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FXNQ16595 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FXNQ16595 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FXNQ16595 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FXNQ16595 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FXNQ16595 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FXNQ16595 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FXNQ16595 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FXNQ16595 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FXNQ16595 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
FXNQ16595 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
FXNQ16595 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FXNQ16595 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FXNQ16595 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FXNQ16595 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FXNQ16595 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FXNQ16595 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FXNQ16595 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FXNQ16595 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FXNQ16595 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FXNQ16595 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FXNQ16595 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FXNQ16595 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FXNQ16595 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FXNQ16595 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FXNQ16595 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FXNQ16595 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FXNQ16595 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FXNQ16595 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FXNQ16595 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FXNQ16595 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FXNQ16595 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FXNQ16595 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FXNQ16595 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FXNQ16595 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FXNQ16595 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FXNQ16595 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FXNQ16595 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FXNQ16595 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FXNQ16595 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FXNQ16595 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FXNQ16595 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FXNQ16595 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FXNQ16595 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FXNQ16595 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FXNQ16595 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FXNQ16595 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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FXNQ16595 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FXNQ16595 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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FXNQ16595 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FXNQ16595 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FXNQ16595 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FXNQ16595 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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FXNQ16595 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FXNQ16595 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FXNQ16595 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FXNQ16595 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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FXNQ16595 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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FXNQ16595 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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FXNQ16595 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
FXNQ16595 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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FXNQ16595 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FXNQ16595 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FXNQ16595 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FXNQ16595 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FXNQ16595 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FXNQ16595 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FXNQ16595 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FXNQ16595 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FXNQ16595 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FXNQ16595 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FXNQ16595 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FXNQ16595 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FXNQ16595 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FXNQ16595 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FXNQ16595 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FXNQ16595 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FXNQ16595 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FXNQ16595 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FXNQ16595 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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