Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPNMBQ14956 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPNMBQ14956 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPNMBQ14956 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
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