Protein–RNA interactions for Protein: Q13068

GAGE4, G antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAGE4Q13068 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAGE4Q13068 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GAGE4Q13068 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms