Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHRNEQ04844 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHRNEQ04844 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 231.6 ms