Protein–RNA interactions for Protein: P55285

CDH6, Cadherin-6, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH6P55285 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH6P55285 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH6P55285 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH6P55285 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH6P55285 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH6P55285 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH6P55285 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH6P55285 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH6P55285 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH6P55285 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH6P55285 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH6P55285 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH6P55285 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH6P55285 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH6P55285 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CDH6P55285 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH6P55285 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH6P55285 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH6P55285 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH6P55285 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH6P55285 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH6P55285 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH6P55285 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH6P55285 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH6P55285 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH6P55285 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH6P55285 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH6P55285 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH6P55285 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH6P55285 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH6P55285 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH6P55285 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH6P55285 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH6P55285 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH6P55285 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH6P55285 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH6P55285 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH6P55285 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH6P55285 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH6P55285 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH6P55285 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH6P55285 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH6P55285 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH6P55285 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH6P55285 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH6P55285 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH6P55285 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH6P55285 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH6P55285 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH6P55285 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH6P55285 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH6P55285 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH6P55285 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH6P55285 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH6P55285 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH6P55285 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH6P55285 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH6P55285 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH6P55285 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH6P55285 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH6P55285 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH6P55285 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH6P55285 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH6P55285 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH6P55285 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH6P55285 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH6P55285 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH6P55285 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH6P55285 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CDH6P55285 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH6P55285 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH6P55285 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH6P55285 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH6P55285 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH6P55285 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH6P55285 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH6P55285 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH6P55285 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH6P55285 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH6P55285 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH6P55285 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH6P55285 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH6P55285 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH6P55285 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH6P55285 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH6P55285 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH6P55285 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH6P55285 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH6P55285 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH6P55285 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH6P55285 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH6P55285 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH6P55285 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH6P55285 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH6P55285 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH6P55285 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH6P55285 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH6P55285 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH6P55285 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH6P55285 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms