Protein–RNA interactions for Protein: P52292

KPNA2, Importin subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA2P52292 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KPNA2P52292 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms