Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMB4P28070 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms