Protein–RNA interactions for Protein: P23508

MCC, Colorectal mutant cancer protein, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCP23508 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCCP23508 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MCCP23508 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCCP23508 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCCP23508 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCCP23508 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCCP23508 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCCP23508 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCCP23508 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MCCP23508 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCCP23508 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCCP23508 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCCP23508 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCCP23508 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCCP23508 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCCP23508 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MCCP23508 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCCP23508 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCCP23508 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCCP23508 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCCP23508 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCCP23508 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCCP23508 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCCP23508 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCCP23508 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCCP23508 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCCP23508 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCCP23508 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCCP23508 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MCCP23508 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCCP23508 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCCP23508 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCCP23508 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCCP23508 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCCP23508 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MCCP23508 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCCP23508 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MCCP23508 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MCCP23508 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCCP23508 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCCP23508 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCCP23508 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCCP23508 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCCP23508 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCCP23508 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCCP23508 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCCP23508 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCCP23508 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCCP23508 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCCP23508 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCCP23508 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCCP23508 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCCP23508 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCCP23508 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCCP23508 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCCP23508 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCCP23508 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCCP23508 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCCP23508 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCCP23508 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCCP23508 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCCP23508 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCCP23508 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCCP23508 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCCP23508 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCCP23508 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCCP23508 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCCP23508 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCCP23508 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCCP23508 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCCP23508 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCCP23508 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCCP23508 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCCP23508 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCCP23508 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCCP23508 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCCP23508 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCCP23508 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCCP23508 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCCP23508 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCCP23508 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCCP23508 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCCP23508 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCCP23508 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCCP23508 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCCP23508 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
MCCP23508 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
MCCP23508 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCCP23508 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCCP23508 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCCP23508 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCCP23508 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCCP23508 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCCP23508 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCCP23508 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCCP23508 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCCP23508 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCCP23508 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCCP23508 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCCP23508 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms