Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LCA5LO95447 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LCA5LO95447 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LCA5LO95447 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCA5LO95447 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCA5LO95447 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCA5LO95447 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCA5LO95447 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCA5LO95447 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCA5LO95447 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCA5LO95447 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCA5LO95447 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCA5LO95447 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCA5LO95447 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LCA5LO95447 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCA5LO95447 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCA5LO95447 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCA5LO95447 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LCA5LO95447 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCA5LO95447 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCA5LO95447 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCA5LO95447 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCA5LO95447 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCA5LO95447 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCA5LO95447 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCA5LO95447 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCA5LO95447 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCA5LO95447 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCA5LO95447 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCA5LO95447 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCA5LO95447 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCA5LO95447 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCA5LO95447 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCA5LO95447 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCA5LO95447 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCA5LO95447 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.6 ms