Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMAD6O43541 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD6O43541 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms