Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
ARID3CA6NKF2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC34.89■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ARID3CA6NKF2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.2 ms