Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC78A2IDD5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC78A2IDD5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms