Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X0

DPM3, Dolichol-phosphate mannosyltransferase subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPM3Q9P2X0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPM3Q9P2X0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPM3Q9P2X0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPM3Q9P2X0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPM3Q9P2X0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPM3Q9P2X0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DPM3Q9P2X0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPM3Q9P2X0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPM3Q9P2X0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPM3Q9P2X0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPM3Q9P2X0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPM3Q9P2X0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPM3Q9P2X0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DPM3Q9P2X0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPM3Q9P2X0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPM3Q9P2X0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPM3Q9P2X0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DPM3Q9P2X0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPM3Q9P2X0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPM3Q9P2X0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPM3Q9P2X0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPM3Q9P2X0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPM3Q9P2X0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DPM3Q9P2X0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPM3Q9P2X0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DPM3Q9P2X0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DPM3Q9P2X0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms