Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP59

SLC40A1, Solute carrier family 40 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC40A1Q9NP59 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC40A1Q9NP59 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms