Protein–RNA interactions for Protein: Q99608

NDN, Necdin, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNQ99608 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDNQ99608 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDNQ99608 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDNQ99608 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDNQ99608 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDNQ99608 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NDNQ99608 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NDNQ99608 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDNQ99608 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDNQ99608 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDNQ99608 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDNQ99608 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDNQ99608 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDNQ99608 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NDNQ99608 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDNQ99608 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDNQ99608 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDNQ99608 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDNQ99608 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDNQ99608 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDNQ99608 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDNQ99608 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDNQ99608 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NDNQ99608 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDNQ99608 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDNQ99608 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDNQ99608 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDNQ99608 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDNQ99608 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NDNQ99608 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDNQ99608 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDNQ99608 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDNQ99608 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDNQ99608 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDNQ99608 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDNQ99608 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDNQ99608 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDNQ99608 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDNQ99608 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDNQ99608 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDNQ99608 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDNQ99608 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NDNQ99608 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDNQ99608 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDNQ99608 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDNQ99608 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDNQ99608 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDNQ99608 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDNQ99608 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDNQ99608 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDNQ99608 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDNQ99608 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDNQ99608 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDNQ99608 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDNQ99608 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDNQ99608 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDNQ99608 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDNQ99608 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDNQ99608 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDNQ99608 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDNQ99608 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDNQ99608 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDNQ99608 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDNQ99608 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDNQ99608 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDNQ99608 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDNQ99608 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDNQ99608 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDNQ99608 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDNQ99608 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDNQ99608 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDNQ99608 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDNQ99608 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDNQ99608 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDNQ99608 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDNQ99608 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDNQ99608 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NDNQ99608 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDNQ99608 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDNQ99608 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDNQ99608 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDNQ99608 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDNQ99608 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDNQ99608 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDNQ99608 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDNQ99608 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDNQ99608 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDNQ99608 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NDNQ99608 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDNQ99608 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDNQ99608 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDNQ99608 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDNQ99608 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDNQ99608 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDNQ99608 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDNQ99608 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDNQ99608 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDNQ99608 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDNQ99608 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDNQ99608 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms