Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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SAMD8Q96LT4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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SAMD8Q96LT4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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SAMD8Q96LT4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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SAMD8Q96LT4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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SAMD8Q96LT4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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SAMD8Q96LT4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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SAMD8Q96LT4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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SAMD8Q96LT4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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SAMD8Q96LT4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAMD8Q96LT4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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