Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WASHC2DQ5SRD0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
WASHC2DQ5SRD0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms